本病的临床体现对照繁杂，每每给诊断带来难题，误诊率相当高，约1/4病人靠腹腔镜磨炼、剖腹探查或尸身磨炼才赢得诊断，海外汇报漏诊者乃至达50％，因而更需抬高警觉，用心实行区别诊断。
1）以发烧为要紧体现者有稽留热的患者，需与伤寒区别。后者有伤寒*血症，包罗模样冷漠、听力消退、相对缓脉，有意看来皮肤蔷薇疹。进一步可采血、尿、粪培植伤寒杆菌，实行伤寒血清学诊断，包罗Widal反映（肥达氏实验）、酶联免疫吸附实验、胶乳凝结实验等，可资区别。有弛张热的患者响应败血症、肝脓肿、肝癌、传染性心内膜炎、淋巴瘤等区别。
2）以腹水为要紧体现者若腹水磨炼不齐全合乎渗出性时，响应肝强硬腹水区别；理论上肝强硬腹水的病人有意可兼并结核性腹膜炎。腹水为血性者需斟酌癌性腹水的也许性，腹膜癌肿多为继发性者，应专一磨炼消除胃、肝、大肠、胰、盆腔等脏器的癌肿。关于女性患者，随时警觉卵巢肿瘤，准时地实行盆腔磨炼及B型超声磨炼极度要害。腹水固执不用者响应缩窄性心包炎、肝静脉滞碍归纳征或胰源性腹水区别。
（1）腹腔恶性肿瘤：包罗恶性淋巴瘤、腹膜变化癌、腹膜间皮瘤等。临床经常接见到肿瘤原发灶相当隐藏云尔有普及腹膜变化的患者，此时与结核性腹水区别有相当难题。腹水细胞学磨炼假若法子妥善，阳性率相当高且假阳性少，如充饥水找到癌细胞，腹膜变化癌也许确诊。可同时经过B超、CT、内镜等磨炼寻求原发癌灶（寻常以肝、胰、胃肠道及卵巢癌肿罕见）。原发性肝癌或肝变化癌、恶性淋巴瘤在未有腹膜转瞬息，腹水细胞学磨炼为阴性，此时要紧靠B超、CT等磨炼寻求原发灶。对腹水细胞学磨炼未找到癌细胞而结核性腹膜炎和腹腔肿瘤区别有难题者，腹腔镜磨炼多可明了诊断。须要时可行诊断性抗结核医治。
（2）肝强硬腹水：肝强硬腹水为漏出液，而且伴失代偿期肝强硬的模范体现，区别无难题。题目是肝强硬腹水兼并结核性腹膜炎时，因结核性腹膜炎的临床体现不模范且腹水可靠近漏出液，就简单漏诊或不易与原发性细菌性腹膜炎区别。假若患者腹水以淋巴细胞为主，通常细菌培植阴性，格外是有结核病史、来往史或伴随其余器官结核病灶，应留神肝强硬兼并结核性腹膜炎的也许，须要时行腹腔镜磨炼。
（3）其余疾病引发的腹水，如结缔机关病、Budd-Chiari归纳征、Meigs归纳征、缩窄性心包炎等。
3）以腹痛为要紧体现者可遵循腹痛产生的缓急，斟酌慢性或急性腹痛各罕见疾病。慢性腹痛响应Crohn病、消化性溃疡、慢性胆囊炎、慢性阑尾炎、非结核性不齐全性肠滞碍、慢性盆腔炎等区别。结核性腹膜炎可由于干酪样坏死灶溃破而引发急性腹膜炎，或由于肠滞碍而产生急性腹痛，此时应与罕见的急腹症加以区别。
4）以腹部肿块为要紧体现者腹部肿块可涌目前不同部位，具备不同性状，也许酷似肝、脾、胃、胆囊、肾、卵巢等器官的病变。腹部涌现包块响应腹部肿瘤及克罗恩（Crohn）病等区别。应专一从病史与体征，连系相关的帮忙磨炼事实，实行区别诊断。有意需经剖腹探查才华赢得确诊。
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